明治　７年　開新学校（創立開校）

明治　８年　日就学校

明治１９年　尋常科山上小学校
　　　明治１９年　簡易科設置
　　　　　　　　　（和南、佐目、相谷、萱尾、蓼畑、杠葉尾）

明治２５年　山上村立山上尋常小学校
　　　明治２５年　簡易科を廃し分教場設置
　　　　　　　　　（和南、佐目、相谷、萱尾、蓼畑、杠葉尾）

明治２９年　山上村立山上尋常高等小学校　　　　
　　　大正１２年　和南分教場本校に編入

昭和１６年　山上村立山上国民学校

昭和１８年　永源寺村立山上国民学校（隣村合併）高野国民学校と統合

昭和２２年　永源寺村立山上小学校

昭和３０年　永源寺町立山上小学校（町村合併）
　　　　　　　　昭和３４年　体育館竣工
　　　　　　　　昭和３８年　校舎完成
　　　昭和４４年　和南分校本校統合
　　　昭和４６年　佐目分校本校統合
　　　　　　　　昭和４８年　プール竣工
　　　昭和５６年　相谷分校本校統合

平成１６年　東近江市立山上小学校（市町村合併）
　　　　　　　　平成１６年７月　新校舎竣工
　　　　　　　　平成１７年４月　新体育館竣工
　　　　　　　　平成１８年８月　新プール竣工
　　　　　　　　平成１９年５月　運動場改修竣工
　　　平成２１年　政所小学校統合
　　　平成２３年　甲津畑小学校統合